No, tak v tom případě je to jednoduché (manžel teda taky pracuje v ČR?) - to už jste právně naprosto Češi a budete se řídit českými právními předpisy...

Takže:
jestli tomu dbře rozumím, tak jsi pracovaa v ČR, pak jsi v ČR nastoupila na MD, pakjste se přestěhovali do SR, takže ti rodičák vypláceli tam, teď ještě bereš rodičák, ale už v Čr, protože jste se přestěhovali zpět. Ty 2 MD na sebe navazovaly?

A manžel pořád pracuje, střídavě v Čr a v SR.

No, takže manžel je účasten nemocenského poj. pořád - v ČR i v SR je nem. poj. pro zaměstnance povinné a srážené z hrubé mzdy. Ty jsi byla účastna nem. poj. před nástupem na 1. MD. Takže - mělo by to být tak, že:
když otěhotníš tak, aby na sebe současný RD a nové těhotenství navazovalo, tak bys měla mít nárok na MD ze svého pojištění. Když ti rodičák skončí, ty nebudeš těhotná, nastoupíš do práce nebo budeš OSVČ dobrovolně pojištěná, pak otěhotníš, tak budeš mít taky nárok na MD - ale z tohoto nového pojištění. Když ti rodičák skončí, ty budeš na úřadu práce a pak otěhotníš, tak nebudeš mít MD.

Výše rodičáku je od příštího roku stejně fix, rozdělitelný na libovolný počet měsíců...

Prostě, teď jste znovu plně Češi, tak se řiď jenom právem ČR, stejně jako každá jiná mamina.