Cystickou fibrosu určuje CFTR protein (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator = transmembránový regulátor vodivosti) reguluje transport chloridových iontů, který je důležitý pro funkci plic, horních cest dýchacích, pankreatu, jater, potních žlaz a pohlavního ústrojí.

V současnosti se v ČR používá model, kdy se v prvním kroku vyšetří imunoreaktivní trypsin (IRT). To je produkt slinivky břišní, jehož koncentrace
bývá v krvi novorozených dětí s CF o něco vyšší než u dětí ostatních, i když ne všechny děti se zvýšeným IRT mají CF. Pokud je koncentrace IRT zvýšená, následuje ve druhém kroku DNA analýza nejčastějších mutací CFTR genu.