Pokud nejsi plátce DPH, potom při dovozu odvedeš státu kromě cla ještě DPH z dováženého zboží. Proto se někdy vyplatí stát se plátcem jen kvůli tomu dovozu, ale zase ho pak odvedeš při prodeji. Obecně je asi lepší plátce nebýt. Povinnost stát se jím se řídí nějakými limity, obrat asi 750tis/12 měsíců, u dovozu nevím ... snad někdo bude vědět nebo pohledej jinde či se obrať na nějakou účetní.
Podvojné účetnictví nemusíš vést ani jako plátce DPH. Do nákladů si dáš skutečně zaplacenou cenu - prokážeš bankovním výpisem z bankovní platby. Clo a DPH (pokud nejsi plátce) ti pak celníci vypočtou z komerční faktury od dodavatele. Pokud jsi plátce, platíš jen clo.