Škrob trvanlivost zkracuje, tojo, je vhodným substrátem pro mikroby. ale při správně provedené sterilaci (to opravdu není otočení na víčko, u něčeho, co obsahuje minimum cukru, protože jinak to steriluje ten cukr) je pravděpodobnost mikrobiální kontaminace velmi malá a skladování bych se nebála.
Spíš bych něco takového vůbec nevyráběla, protože nechápu, proč patlat domácí přesnídávky a "voroštovat" je dosti ohavnými barvivy a ethylvanilinem z kupovaného pudinku (nemá to jen takový ten drahý od Oetkera, pokud vím).
Nevidím nic zlého na nezahuštění.
A když už zahušťovat, tak bych dala rozhodně přednost pektinu. Buď kupovanému (ale pozor u alergie na citrusy, delá se z citrusů), nebo domácím odvarem z jablečných šlupek a ohryzků, co zbudou po výrobě toho pyré. Pektin není pro mikroby taková lahůdka jako škrob, většina ho moc neumí štěpit.